timsTOF Pro 在 4D DIA 蛋白组学中的应用优势

随着生物医学、药物研发和精准医疗的不断发展，蛋白组学技术正逐渐从基础研究走向临床转化。而数据无依赖采集（DIA, Data-Independent Acquisition）则因其高通量、高重现性、低缺失率等特性，在大规模蛋白质定量分析中崭露头角。但传统DIA方法仍面临“共碎片干扰严重、识别通量有限”等挑战。Bruker推出的timsTOF Pro质谱平台，通过引入4D（包含离子迁移谱）数据维度，大幅提升了DIA的性能表现。特别是结合其独创的PASEF技术（Parallel Accumulation–Serial Fragmentation），在蛋白质识别深度、定量准确性与通量之间实现了更优平衡。

一、什么是4D DIA？

传统DIA主要采集三个维度的数据：质荷比（m/z）、保留时间（RT）、以及碎片强度。4D DIA则在此基础上引入离子迁移时间（Ion Mobility, IM），形成m/z - RT - IM - Intensity的四维数据矩阵。

而timsTOF Pro内置的Trapped Ion Mobility Spectrometry（TIMS）模块，使得离子在气相中根据大小和形状被分离，有效增加了谱图的分辨率，并提升了肽段和蛋白质的识别能力。

二、timsTOF Pro 的核心技术优势

1、PASEF 技术显著提升扫描速度与灵敏度

传统DIA质谱在提高通量时往往牺牲灵敏度，而timsTOF Pro 的PASEF技术则打破这一限制：

• 每秒可采集超过100张MS/MS谱图；

• 灵敏度提升可达10倍以上；

• 实现高深度、高速度的数据采集。

这意味着研究者无需进行过度分组或重复进样，也能获得丰富而准确的蛋白质定量数据。

2、4D分离提升谱图解析能力，减少共碎片干扰

离子迁移谱提供额外的分离维度，可有效区分m/z接近但迁移率不同的肽段，降低同窗干扰：

• 增强肽段识别率；

• 提高低丰度蛋白的检出能力；

• 有助于复杂样本（如血清、组织）的深度解析。

3、兼容多种4D DIA工作流，满足不同研究需求

Bruker 与多家软件开发方合作，推出一系列适配timsTOF的4D DIA分析流程：

• diaPASEF：最经典的4D DIA模式，适合高深度探索型研究；

• Slice-PASEF：适合快速大样本筛查场景；

• g-diaPASEF：结合标准品支持绝对定量。

三、百泰派克生物科技：一站式高质量timsTOF蛋白组学服务提供商

作为专注于质谱技术和多组学服务的高端科研服务机构，百泰派克生物科技已率先引入Bruker timsTOF Pro 2平台，结合自主优化的4D DIA工作流程和数据分析策略，提供如下优势服务：

• 高深度蛋白质鉴定（>10,000蛋白/样本）；

• 稳定的定量精度（CV < 15%，支持Label-free绝对定量）；

• 定制化实验设计与生信分析报告；

• 快速交付（最快7个工作日）。

4D DIA结合timsTOF Pro，为复杂蛋白质组的全面解析带来了前所未有的可能。其出色的速度、分辨率和数据质量，使其成为当前最具发展潜力的质谱平台之一。如果您正计划开展高通量蛋白组学研究，或希望借助先进技术深入挖掘生物标志物、疾病机制，欢迎联系百泰派克生物科技，获取定制化方案与技术支持。

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