质谱自下而上法分析蛋白

质谱自下而上法分析蛋白，将蛋白消化后的肽段进行质谱分析，从而实现对蛋白质的分析的质谱分析方法。百泰派克生物科技提供基于质谱的自上而下的蛋白质分析服务。

质谱自下而上法分析蛋白

质谱自下而上法分析蛋白，将蛋白消化后的肽段进行质谱分析，从而实现对蛋白质的分析的过程，这种从肽段分析到蛋白分析的顺序称为自下而上。质谱自下而上法分析蛋白，首先用胰蛋白酶等蛋白酶对感兴趣的蛋白质进行消化，然后再用质谱分析产生的肽段。自下而上的蛋白质组学也是将蛋白质酶切消化成肽段后，通过分析肽段实现对蛋白质混合物的分析。复杂的肽段混合物可以采用反相液相色谱(RP-LC)结合串联质谱(MS/MS)的方法进行分析。最终肽和蛋白质的鉴定通过匹配肽段离子谱和蛋白质数据库产生的理论光谱来实现。

质谱自下而上法分析蛋白的原因

之所以质谱分析蛋白会使用自下而上的方法，主要是因为质谱仪的测量范围难以实现对完整蛋白质的质量和序列进行测定。因此，在质谱法分析蛋白质时需要先将蛋白质进行酶消化，以获得尽可能多的长度合适的肽片段来进行质谱分析。一般来说，由6个至20个氨基酸组成的肽片段较适合质谱分析以及之后的数据库比对。少于6个氨基酸的肽段不能在数据库中得到唯一匹配，而多于20个氨基酸的肽段则难以获得序列信息。

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