SWATH蛋白组学

SWATH是一种基于质谱的数据非依赖性的扫描采集模式,主要应用于蛋白质组定量、和宿主蛋白分析等研究中。百泰派克生物科技提供SWATH定量蛋白组学服务

SWATH技术

SWATH(Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ions)是一项全新的质谱采集模式技术,属于一种DIA (Data Independent Acquisition)技术。SWATH将整个质谱扫描质量范围分为若干小窗口,依次对每个窗口的所有离子进行碎裂,使其能够对扫描区间内的所有肽段离子进行高速一级MS扫描并采集所有母离子的碎片离子进一步进行二级MS/MS分析。SWATCH技术可以鉴定复杂样品中的所有分子,包括低表达蛋白和低丰度的被修饰蛋白,且具有高通量和精准度高的特点。

SWATH蛋白组学

SWATH蛋白组学主要是利用SWATH技术进行定量蛋白质组研究。与label free技术一样,SWATH技术可以不用进行样品的标记而对样品蛋白进行定量。SWATH定量蛋白组首先是对细胞或组织等样品进行蛋白提取和纯化,接着对纯化蛋白进行还原打开蛋白二硫键,并使用Trypsin等蛋白酶将蛋白酶切成多肽片段,多肽片段混合溶液经过LC-MS色谱质谱串联分析技术进行分离和SWATH质谱分析,最后通过软件分析质谱数据从而对蛋白质组进行鉴定和定量。SWATH对仪器扫描速度和检测精度要求很高,常用作SWATH分析的仪器平台为AB SCIEX Triple-TOF 5600-plus或同系列更高端版本的质谱仪。

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