宏蛋白质组学分析

宏蛋白质组学是大规模的定性和定量分析蛋白质以分析环境中的微生物群落的一门学科。百泰派克生物科技提供基于质谱的宏蛋白质组学分析服务。

宏蛋白质组学

宏蛋白质组学也称为环境蛋白质组学,是通过对环境菌群中某一时刻的所有蛋白的详尽描述,从而揭示微生物表型信息的一门学科。宏蛋白质组数据集的分析提供了有关微生物群落的结构、功能和动态的信息,这对于提高对微生物的招募、营养资源竞争、代谢活动和整个群落的防御系统分布的理解至关重要。例如,针对人类口腔微生物组的宏蛋白质组学研究发现人类口腔中有50个细菌属,该结果与人类微生物组计划的结果一致。宏蛋白质组学可以用于分析微生物的共生关系、宿主-病原体的关系和宿主之间的关系。

宏蛋白质组学分析

宏蛋白质组学分析

宏蛋白质组学分析方法

成功的宏蛋白质组学测量取决于三个要素:从环境样品中有效提取蛋白质,在检测之前分离蛋白质或多肽,最后是对蛋白质和多肽进行高通量的清晰鉴定。当前,宏蛋白质组学分析常常使用基于液相色谱的分离技术以及基于质谱的肽段鉴定技术进行。采用自下而上的策略,首先使用胰蛋白酶将蛋白质消化成肽,然后进行色谱分离,并随后通过质谱或串联质谱进行分析。该方法可以对建立了基因组的环境微生物群落进行研究。

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