使用DEseq2进行转录组差异表达分析，实验组和对照组样本数量必须相同吗？

使用DEseq2进行转录组差异表达分析时，实验组和对照组样本数量并不一定要相同。DEseq2基于负二项分布模型来估计基因表达的离散性，并使用负二项分布模型来进行差异表达分析。

DEseq2对于实验组和对照组样本数量的要求并不严格。实际上，DEseq2可以处理不同条件下的不同样本数量。在DEseq2中，样本数量的不同会影响到差异表达分析的统计功效和结果的可靠性。当实验组和对照组样本数量不同时，DEseq2会根据样本数量的不同来调整差异表达分析的统计模型。具体来说，DEseq2会使用负二项分布模型来估计每个基因的离散性，并根据样本数量的不同来调整模型的参数。这样可以更准确地估计基因表达的离散性，并提高差异表达分析的统计功效。

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