蛋白分析FAQ汇总

• • 做WB时，buffer加多了怎么办

  在进行Western Blot（WB）实验中，如果不小心向缓冲液中加入了过多的Buffer，这可能影响蛋白的转移、结合或者信号的检测。解决这个问题的方法取决于具体情况和实验的阶段。以下是一些可能的情况和对应的解决策略：   1. 样品制备阶段 如果是在样品制备阶段加入过多的Buffer，比如

• • COG功能注释分析怎么写，就写哪一类的占比最多吗

  使用COG数据库进行功能注释分析不仅可以分析哪一类功能的基因占比最多，还可以更详细地探讨基因在各个生物学功能类别中的分布。以下是一份COG功能注释分析的撰写方法，希望对您有所帮助。1. 引言在引言部分，简要介绍COG数据库的重要性和其主要用途。阐明使用COG数据库对特定基因组或蛋白质数据集进

• • 盐酸胍可以进质谱吗

  不可以，盐酸胍（Gu-HCl 或 Guanidine Hydrochloride）通常用作蛋白质样本的变性剂，可以帮助在蛋白质质谱分析之前解开蛋白质的三维结构。在蛋白质质谱（Proteomics）中，使用盐酸胍处理蛋白质样本有助于提高肽段的提取效率和鉴定的覆盖度。然而，盐酸胍本身也会对质谱分

• • 有bluenative page的protocol吗?不知道怎么配胶

  本文描述了BN-PAGE配胶的基本方法，可供参考，具体条件（如浓度、pH值等）需要根据样品和实验目的进行优化。

• • string中有一个基因找不到,做蛋白互做怎么办

  如果在研究中的DNA序列（string）中找不到某个特定的基因，但需要进行蛋白质相互作用（蛋白互作）分析时，可以采取以下几种策略来应对这种情况：   1.重新评估DNA序列： 首先确认DNA序列的准确性和完整性。有时候，可能由于序列错误或遗漏，导致无法识别特定的基因。使用不同的生物信息学工具

• • 贵公司怎么处理生物样品的

  百泰派克生物科技可以根据客户需求免费定制样品制备方法，满足多种不同的需求。我们对样品的处理包括： 组织、细胞均质化 样品净化（去除DNA和RNA，减少s-s键，蛋白质） 消除样品中高丰度蛋白质 蛋白质提取 蛋白质纯化 蛋白质浓缩 蛋白质水解消化 对于蛋白质水解，我们也可提供两种水解蛋

• • 有什么质谱的分析软件

  在质谱分析中，尤其是蛋白质组学研究中，有多种软件和工具被广泛使用来处理和分析数据，包括肽链的识别、定量和拼接。这些软件利用复杂的算法分析质谱数据，以鉴定肽段和蛋白质，处理信号强度，以及进行其他相关的生物信息学分析。以下是一些常用的质谱软件：   1.MaxQuant： 是一款流行的用于蛋白质

• • 蛋白质的磷酸化和乙酰化这种性质在深度学习中应用广吗?做生物信息学关于蛋白质磷酸化、乙酰化性质的预测这个方向有意义吗?

  蛋白质的磷酸化和乙酰化是两种重要的翻译后修饰，它们在调控蛋白质的功能和细胞信号传递过程中起着关键作用。蛋白质的磷酸化通常涉及到一个特定氨基酸残基（如丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸）的羟基与磷酸基团的加成反应，而乙酰化则涉及到蛋白质N端或者赖氨酸残基的氨基上添加乙酰基。这些化学修饰改变了蛋白质的电荷、

• • 做蛋白质组学能看出蛋白质巯基、羰基的变化吗（已经做了巯基、羰基的理化指标,怕后面做蛋白质组学跟这个理化指标的趋势对不上）？

  是的，蛋白质组学可以用来观察和分析蛋白质巯基和羰基的变化。通过使用特定的质谱技术和生物标记，蛋白质组学可以准确识别和定量蛋白质中的巯基和羰基修饰。    巯基变化：蛋白质的巯基主要来自于半胱氨酸残基的硫醇（-SH）基团，它们在蛋白质的折叠、稳定性以及活性中扮演着重要角色。巯基状态的变化，

• • 一条肽链被打成几个片段,能否拼接起来,那拼接后的intensity是全部相加吗（因为有些是重复的）?

  在质谱分析中，特别是在蛋白质组学的背景下，通过使用质谱仪得到的肽链碎片确实可以拼接起来。这是通过对质谱数据进行生物信息学分析来实现的，其中算法会根据碎片的质量/电荷比值（m/z）对它们进行排序和匹配，以重建原始的肽链序列。 关于拼接后碎片的强度（intensity）问题，一般来说，各个