DDA和DIA有什么区别？

DDA和DIA都被认为是自下而上蛋白质组学中基于发现的方法。这意味着在这两种情况下，蛋白质都被酶消化成更小的肽，并从肽中提取信息以推断蛋白质水平的结论。在DIA中，几乎所有肽段都被片段化在一起，然后使用质谱法进行分析。这种技术会产生复杂的碎裂 (MS2) 谱图，但会收集整个保留时间范围内所有肽的 MS2 数据。在这些初始步骤之后，DIA方法使用光谱库从高度丰富的数据中提取信息，并允许在MS2级别进行量化。由于这些特性，DIA提供了无与伦比的精密度和定量准确度、改进的可复制性以及比DDA更全面的肽采样。与DIA相比，DDA模式下的质谱仪仅选择某些肽，然后将它们片段化，理想情况下一次一个。虽然DIA是定量目标的优越采集方法，但DDA是库生成和数据库搜索的首选方法，因为它具有接近肽特异性的MS2光谱。当与深度分馏结合使用时尤其如此。基于应用于现有蛋白质数据库的搜索引擎算法，DDA可以快速提供识别结果。



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• DIA定量蛋白质组学