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百泰派克

SWATH定量蛋白组学服务

SWATH(Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ions)由ETH Zürich的Dr. Ruedi Aebersold团队与AB SCIEX共同研发的一项全新的质谱采集模式技术。SWATH作为一种DIA (Data Independent Acquisition)技术,将整个质谱扫描质量范围分为若干小窗口,依次对每个窗口的所有离子进行碎裂,使其能够对扫描区间内的所有肽段离子进行高速一级MS扫描再进行二级MS/MS分析。因此,SWATH能够对复杂样品中几乎所有可检测的分子进行定量测定。SWATH综合了shotgun proteomics高通量检测的特点与精准定量分析的优势,是真正意义上的全景质谱检测手段MS/MS ALL。 百泰派克公司采用AB SCIEX Triple-TOF 5600 plus高分辨质谱系统,具有快速扫描速度和串联四极杆质谱系统的定量灵敏度能力,集质谱系统的高分辨、准确质量数稳定性、高灵敏度和高速度扫描特点于一身,推出SWATH定量蛋白组分析服务技术包裹,您只需要将您的样品寄给我们,我们会负责项目后续所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。

SWATH定量蛋白组学服务技术平台

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SWATH定量蛋白组学服务技术平台

SWATH技术特点

• 定量鉴定复杂的样品中所有分子,包括低丰度蛋白和肽段
• 定量准确度高:定量准确度与MRM技术相当
• 通量大:一次实验可定量检测到2000种以上蛋白
• 完整全面信息存储,能够存储MS,MS/MS每个峰值的数据,同一样本无需进行重复检测
• 无需像MRM技术需要提前调试样品测定方法

SWATH/DIA的优势介绍

对于复杂样品定量分析主要的问题往往来自于样品本身高丰度蛋白的干扰,从而难以鉴定到低丰度蛋白。许多DDA(Data Dependent Acquisition)质谱鉴定方法,都是在MS级别鉴定肽段,优先筛选MS信号强的肽段进行二级碎裂,因此低丰度的肽段不易被选择进行二级分析。而SWATH/DIA则是对样品中的所有分子无差别地进行分析,并一次性将所有肽段的MS,MS/MS数据进行储存,以保证不遗漏任何可能重要的数据。总的来说,SWATH极大地提高了定量分析的可信度,并能够高效测定复杂样品中丰度极低的蛋白分子。

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DDA与SWATH/DIA质谱分析的对比


另外,相比MRM需要根据待检测的目标分子进行检测方法优化,SWATH无偏差分析所有分子,不需要提前对检测方法进行优化,只需要在已获得检测数据的基础上对分析方法进行优化即可。因此,SWATH分析能够为您极大得缩短检测分析的周期。

SWATH定量蛋白组学服务样品要求

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SWATH定量蛋白组学服务样品要求

生物信息学分析

• SWATH谱图分析,蛋白质数据质量评估
• 多组分样本PCA分析
• 鉴定的蛋白功能注释:GO功能注释、 KEGG功能注释和COG功能注释
• 差异表达蛋白统计分析:韦恩图、火山图(Volcano Plot)
• 差异表达蛋白聚类分析:层次聚类、K-means聚类
• 差异蛋白相互作用分析:基于STRING 数据库进行蛋白互作网络分析

中/英文项目报告

在最终的技术报告中,百泰会为您提供详细的中英文双语版技术报告,报告包括:

1. 实验步骤(中英文)
2. 相关的质谱参数(中英文)
3. 质谱图片
4. 原始数据
5. 蛋白差异水平分析
6. 生物信息学分析

SWATH定量蛋白组学一站式服务

您只需下单-寄送样品
百泰派克一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告

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