Preclinical
SEARCH
Home > 关于我们 > Blog > 技术/资源 > 蛋白质从头测序鉴定流程和特点
蛋白质从头测序鉴定流程和特点

蛋白质分子的序列是蛋白质发挥功能的基础。准确测定蛋白质序列在在研究蛋白功能表位,检测商业单克隆抗体,疫苗,以及试剂盒等药物方面有着很重要的作用。虽然目前已有很多对蛋白测序的研究,但是目前对蛋白质精准测序还是不能够像DNA一样快速精准。蛋白测序主要受制于蛋白样品纯化,构成蛋白的氨基酸组成种类众多等复杂因素影响。

这期给大家科普的技术叫做蛋白质从头测序(De novo sequencing),又叫全新蛋白测序,这项技术是根据肽段与惰性气体相碰撞产生的一系列的有规律的片段离子之间的质量差来推断氨基酸序列。我们可以根据肽键断裂处的y离子和b离子来推测氨基酸序列,以及翻译后修饰。De novo sequencing有一项突出的优势,是传统质谱测序不能达到的,那就是不依赖任何蛋白质数据库,对未知蛋白质从头测序。

在传统测序中,往往只能检测蛋白消化后的部分肽段序列,再用这些肽段序列与已知的蛋白数据库进行比对,根据一定算法打分,推算出可能性高的蛋白和序列。

传统的测序的局限有:
1. 质谱测序依赖于公共数据库。 如果所研究的物种的基因组没有完全被测序,或者其中部分没有对应的序列, 那么质谱测序将无法得出正确的鉴定。
2. 使用的搜索引擎的打分和算法可能也会遗漏一部分的肽段和质谱图的匹配, 产生假阳性结果。
3. 如果有点突变或者未知修饰存在的话, 由于搜库算法或者参数设置中没有考虑到, 同样也无法得出正确的结果。
这些传统质谱测序的局限都可能在De novo sequencing中被突破,因此选用De novo sequencing可以提供传统测序至今无法准确评估的服务,包括:蛋白质突变分析、全新蛋白/肽段从头测序、单克隆抗体从头测序等。

De novo sequencing鉴定流程和具体特点

蛋白质分子的序列是蛋白质发挥功能的基础。蛋白质从头测序在在研究蛋白功能表位,检测商业单克隆抗体,疫苗,以及试剂盒等药物方面有着很重要的作用。蛋白质从头测序分析流程


服务项目

蛋白质分子的序列是蛋白质发挥功能的基础。蛋白质从头测序在在研究蛋白功能表位,检测商业单克隆抗体,疫苗,以及试剂盒等药物方面有着很重要的作用。从头测序分析服务项目

服务优势

• 采用高精准度质谱仪Obitrap Fusion Lumos
• 全长测序覆盖率高达100%
• 首位氨基酸测序准确率高达95%
• 样品用量低:蛋白样品仅需100ug,即可完成检测


百泰派克微信公众号二维码
百泰派克定位图标 地址:
北京市朝阳区北新桥三条
百泰派克邮箱图标 邮箱:
info@biotech-pack.com
百泰派克电话图标 电话:
010-57231915
152-0137-7680