基于TMT的蛋白质组学分析

Tandem mass tags, TMT技术是用Thermo公司开发的串联质谱标记技术,主要用于鉴定和定量不同样品中的蛋白质。每种TMT标记试剂由:具有胺反应活性的NHS-酯基团,质量标准化基团和MS/MS报告基团组成。每个标记试剂的同位素标签具有相同的前体质量,试剂标记酶解后的肽段,可与氨基酸N端及侧链的伯胺基团发生反应,再通过报告基团进行检测

TMT技术最多可采用11种稳定同位素标签,可同时比较多达10种不同样本中蛋白质的相对含量,可标记几乎所有的肽或蛋白质样品。由于TMT标记技术能够适用于多达11个样品的特性,TMT被广泛应用于定量蛋白质生物标志物的发现,通过选择2-plex、6-plex或10-plex同位素的标签,可同时比较2组、6组或10组不同样品中蛋白质的相对含量。

基于TMT的蛋白质组学服务工作流程

基于TMT的蛋白质组学服务工作流程

TMT定量分析通过测定肽片段化过程中以串联质谱模式(MS2)标记释放出的片段报告基团离子的强度来进行。在全扫描模式(MS1)下选择前体离子进行碎片化,因为离子选择这一步骤可降低噪声水平,为后续分析步骤提供了有利条件。理想情况下,在前体离子碎片化过程中,仅有一个选定的前体离子发生碎片化。但实际过程中,其他前体离子通常会在指定的m/z窗口中被捕获,并与选定的前体一起碎裂。

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合nanoLC-MS/MS纳升色谱,提供基于TMT的蛋白质组学分析服务。Obitrap Fusion Lumos质谱仪是现在分辨率和灵敏度最高的质谱仪,保证了低丰度肽段碎裂片段鉴定的灵敏度;同时在肽段碎裂过程中采取HCD与ETD结合的模式,保证肽段碎裂片段的完整性。

*TMT蛋白质组学分析技术可用于磷酸化蛋白质组学分析。

关于样品

百泰派克生物科技可对来自液体及固体状态下的样品进行TMT蛋白质组学分析。固体样品,使用冰袋运输即可;溶液样品,可进行真空抽干或冷冻抽干后,使用冰袋运输,也可通过干冰对样品进行运输。欢迎来电咨询。

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